Comptable ou plateforme en ligne : que choisir pour votre cabinet médical ?

Gérer un cabinet médical, c’est jongler entre les patients, l’administratif, un peu de RH (cc hoppi)… et la comptabilité.

Pour de nombreux médecins libéraux, la "comptaa" est vécue comme une charge lourde, chronophage et risquée. Faut-il s’appuyer sur un expert-comptable traditionnel, opter pour un cabinet en ligne ou encore gérer ses comptes via une plateforme automatisée ?

Décryptons ensemble les options pour trouver la solution la plus adaptée.

‍

1. Les risques d’une comptabilité mal tenue

Lorsqu’un médecin ne gère pas correctement sa comptabilité, les conséquences peuvent être lourdes :

• Risque de redressement fiscal : une erreur de déclaration peut entraîner un contrôle de l’administration fiscale et des pénalités financières importantes.
• Majorations et pénalités URSSAF : un oubli ou un retard de paiement des cotisations sociales peut vite coûter cher.
• Impact sur la retraite (CARMF) : une mauvaise gestion peut provoquer des écarts dans les droits à la retraite.
• Perte de temps et de sérénité : rattraper des erreurs comptables prend souvent plus de temps qu’une bonne organisation initiale.
• Mauvaise visibilité financière : sans suivi précis, difficile d’anticiper ses charges, d’investir ou de se verser une rémunération adaptée.

En résumé : une comptabilité mal tenue, c’est une épée de Damoclès au-dessus de la tête du médecin, qui peut compromettre la pérennité de son activité.

‍

2. L’expert-comptable (traditionnel ou en ligne)

Définition

Un expert-comptable peut intervenir soit de façon classique, en cabinet de proximité, soit via une solution en ligne qui digitalise les échanges. Dans les deux cas, il s’agit d’un professionnel inscrit à l’Ordre, capable d’accompagner le médecin dans sa gestion comptable, fiscale et sociale.

Avantages

• Accompagnement humain et personnalisé, que ce soit en face-à-face ou à distance.
• Conseils stratégiques adaptés aux situations complexes (optimisation fiscale, choix juridiques).
• Suivi sécurisé et conformité aux obligations légales.
• Avec la version en ligne : tarifs plus compétitifs, accessibilité 24/7, plateformes intuitives.

Inconvénients

• Les honoraires restent plus élevés que pour une simple plateforme.
• Le contact physique est réduit ou inexistant dans les formules en ligne.
• Dépendance à l’outil numérique pour les solutions dématérialisées.

Le coût oscille entre 100 et 200€HT / mois.

‍

3. Les plateformes / logiciels de comptabilité. Les plateformes / logiciels de comptabilité

Définition

Outils numériques autonomes (comme Indy) qui automatisent la saisie et les déclarations, sans expert-comptable associé.

Avantages

• Coût très bas, parfois moins de 30€/mois.
• Autonomie et accès permanent.
• Automatisation (synchronisation bancaire, déclaration en un clic).

Inconvénients

• Pas de conseil fiscal personnalisé.
• Responsabilité assumée par le médecin.
• Limité aux structures simples.

👉 Ca peut être intéréssant quand vous avez peu de lignes dans votre compta.. mais attention : tout repose sur vous. Faite le calcul entre le temps que vous y passez (et le risque) vs le coût d'un cabinet classique

‍

6. Conseils pratiques pour bien choisir

• Vérifier la spécialisation « professions de santé ».
• Examiner les honoraires et frais cachés.
• Demander une démo ou période d’essai.
• Prévoir la réversibilité (changer sans blocage).
• S’assurer du respect des normes (RGPD, sécurité des données).

‍

Conclusion

Il n’existe pas de solution unique.

Le bon choix dépend de la complexité de votre activité, de votre budget et de votre besoin en accompagnement humain. Un médecin en début de carrière n’aura pas les mêmes attentes qu’un praticien installé depuis 20 ans avec un cabinet structuré. 

Prenez le temps de comparer les offres et n’hésitez pas à demander plusieurs devis.

‍

FAQ

Est-il obligatoire pour un médecin d’avoir un expert-comptable ?\Non, mais fortement recommandé pour sécuriser sa comptabilité et éviter les erreurs.

Quel est le coût moyen d’un expert-comptable pour un médecin ?\De 50€/mois pour une offre en ligne jusqu’à 200€/mois ou plus pour un suivi traditionnel complet.

Peut-on passer d’un logiciel à un expert-comptable facilement ?\Oui, à condition d’avoir une bonne réversibilité des données.

Comment garantir la sécurité des données comptables médicales ?\Vérifiez la conformité RGPD et les certifications des outils ou cabinets choisis.

‍